【行业新闻】使用MassARRAY对NSCLC中体细胞突变进行高度敏感的评估
近日，Agena Bioscience宣布在PLOS ONE发表了一项比较研究，强调使用其基于质谱平台和新的高度灵敏的iPLEX®HS化学物质检测发生在非小细胞肺癌（NSCLC）EGFR、KRAS、BRAF和NRAS的体细胞突变。
肺癌通常使用微创技术进行活检，如薄针状活检和细胞学细胞块，其导致具有最小肿瘤组织的小的异质样品标本。大多数技术如Sanger测序和NGS需要至少20-40％的肿瘤含量来检测低至5％-20％变异等位基因频率（VAF）的突变。因此，由于肿瘤含量不足，使样品不合格。
该研究证明，使用Agena Bioscience的iPLEX HS Lung Panel测试来自医学基金会的179个存档NSCLC临床标本，具有1％的VAF检测限和仅5-10ng的输入DNA。已经使用Agena Bioscience的OncoFOCUS™v2.0或v3.0面板在MassARRAY系统上测试了EGFR，KRAS，NRAS和BRAF的突变标本，具有5-10％VAF的检测限。鉴于iPLEX HS化学物质的敏感性增加，鉴定到先前未检测到的KRAS，NRAS，BRAF和EGFR的另外17个突变（或9.5％以上的突变）。这些额外的突变主要在核心针活检和细胞学细胞块中检测到。
iPLEX®HS Lung Panel在MassARRAY系统上运行，使用扩增和单碱基扩增，随后在质谱仪上进行分析。根据样品中的野生型信号，延伸反应中消耗野生型终止子，并将突变信号的量化终止至非常低的等位基因频率，可以实现更高的灵敏度。
Agena Bioscience科学事务高级总监Darryl Irwin博士说：“iPLEX HS Lung面板的检测限度和DNA输入要求不断增加，成为用于检测肿瘤含量有限的NSCLC标本的理想选择。”
医学基金会表示，“此外，由于8小时的周转时间和每个样本成本低，我们可以对具有较高检测水平的更多样本进行目标筛选，从而潜在地在早期阶段发现突变。”
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